Evaluación de la especificidad del aptámero F-23 marcado con FAM para unir a cepas de Pseudomonas aeruginosa aisladas de pacientes pediátricos con fibrosis quística

Abstract

La FQ es un trastorno hereditario, multisistémico y crónico, causado por variantes genéticas en el gen Regulador de la Conductancia Transmembranal de FQ (CFTR, por sus siglas en inglés), con un modo de herencia autosómica recesiva y que afecta principalmente a la población caucásica. La capa de moco hiperviscoso en las células epiteliales, de las vías aéreas de los pacientes con FQ, es el ambiente propicio para que P. aeruginosa se adhiera y colonice. Un diagnóstico preciso y rápido de infección por P. aeruginosa es esencial para el inicio de un tratamiento adecuado; sin embargo, la identificación inicial es un desafío debido a la enorme diversidad fenotípica que presenta esta bacteria en los pacientes con FQ. Los aptámeros son biomoléculas de ácidos nucleicos (RNA o DNA) monocatenarios cortos (20-180 nucleótidos) y con pesos moleculares bajos (5-50 kDa), capaces de plegarse y formar estructuras únicas estables para unirse con afinidad y especificidad elevada a una variedad amplia de objetivos. La identificación molecular de cepas previamente identificadas bioquímicamente como P. aeruginosa empleando el par de primers PA_SS F/R obteniendo un total de 118 cepas identificadas molecularmente como P. aeruginosa, estandarización de un método con el cual es posible visualizar cantidades similares de UFC a través de tinción de Gram y microscopía óptica, donde la media y desviación estándar de células bacterianas observables por campo de cada grupo fue: cepas de referencia P. aeruginosa (98.04±14.92), no-P. aeruginosa (70.72±12.54), PANS (120.58±20.63), DR1 (103.67±28.21), DR2 (99.39±13.50), MDR (96.62±16.89) y XDR (96.07±10.75). Los resultados obtenidos en la presente investigación muestran que bajo las condiciones en las que fue probado el aptámero F-23 marcado con FAM, es capaz de reconocer a objetivos diana (cepas de referencia P. aeruginosa y cepas clínicas de pacientes pediátricos con FQ), aunque también a cepas de especies de géneros semejantes al género Pseudomonas.