Análisis In Silico para la Predicción de las Rutas Metabólicas en el Microbioma Intestinal de Rattus norvegicus con Dietas Basadas en Edulcorantes

Abstract

Las rutas metabólicas son una sucesión de diversas reacciones que conducen de un sustrato inicial a productos que tienen la finalidad de suplir diferentes necesidades; este proceso es una actividad coordinada y con múltiples propósitos que son definidos por las necesidades de la célula, en este proceso existe una relación de diversos conjuntos enzimáticos, permitiendo, un correcto intercambio de materia y energía entre la célula y su medio. Este informe presenta una aproximación in silico para la predicción de rutas metabólicas en el microbioma intestinal de Rattus norvegicus, bajo el consumo de edulcorantes no nutritivos (ENN) a partir de dos dietas. El objetivo fue: la obtención de proteínas in silico derivadas de microorganismos pertenecientes al microbioma intestinal de ratas Wistar a las que se les suministraron ENN en su dieta; se utilizaron herramientas bioinformáticas aunado a bases de datos públicas como KEGG, MetaCyc y DAVID, se trabajó en una base de datos previamente obtenida por el Laboratorio de Genómica de Enfermedades Psiquiátricas y Neurodegenerativas del INMEGEN. Como resultado, se generó un modelo preliminar de interacción microbiana con base en la integración de secuencias genéticas, anotación funcional y simulación metabólica. Sin embargo, no se logró completar la predicción especifica, solo una representación general, sin embargo, estos resultados abren la puerta a explorar los efectos de los ENN en la microbiota intestinal y su relación con el eje intestino-microbiota-cerebro.