Diferencias en Pterygoplichthys spp. Mediante Código de Barras en Cuatro Localidades de México

Abstract

El pez diablo es una especie exótica invasora, nativa de la cuenca del Amazonas, que habita en aguas dulces y poco profundas y se distribuye desde Costa Rica hasta Argentina. Uno de los mayores problemas que representa este grupo de peces es la identificación de las especies, es por ello que en este trabajo se analizaron las diferencias entre las poblaciones de Pterygoplichthys spp. por código de barras, específicamente con el gen mitocondrial citocromo oxidasa 1 (COX1), para comparar la variabilidad del gen en estas especies. La metodología de este trabajo consistió en una comparación de las secuencias extraídas de COX1 de los organismos capturados del presente estudio, con las registradas en GenBank y BOLD. También un alineamiento de secuencias, utilizando el programa MEGA 11. Finalmente, se elaboró un dendrograma para la representación gráfica de la similitud, se agregaron 14 secuencias del GenBank de organismos del mismo género y de un organismo de otra familia (Callichthyidae) para enraizar el árbol. Se analizaron 212 secuencias de organismos de Pterygoplichthys spp., de las cuales, se obtuvieron 26 secuencias viables. Al compararlas con los datos de las bases antes mencionadas, hubo una similitud del 100% con P. pardalis, P. scrophus, P. joselimaianus, P. disjunctivus e Hypostomus plecostomus. El alineamiento dio como resultado la ausencia de variabilidad en el gen COX1 y la matriz de distancias dio un 0% de divergencia entre las secuencias muestreadas. El árbol de similitud arrojó tres grupos diferentes, en una rama las secuencias de este estudio, en la segunda rama las secuencias que se añadieron del mismo género; y el tercer grupo fue del organismo de la familia Callichthyidae.

The Sailfin Catfish is a native species to the Amazon River basin that inhabits fresh and shallow waters from Costa Rica to Argentina, but has become an invasive exotic species in many other regions and countries. One of the major problems of this group fish is species’ identification, therefore, we analyzed the differences between populations of Pterygoplichthys spp. by barcoding, specifically with the mitochondrial gene cytochrome oxidase 1 (COX1) to compare the variability of the gene in these species. We performed a comparison of the COX1 sequences extracted from captured organisms with those registered in GenBank and BOLD. Also, we performed sequence alignment, using the program MEGA 11. Ink. Finally, a dendrogram was constructed to represent the genealogy, adding 14 GenBank sequences from organisms of the same genus and one organism from another family 3 (Callichthyidae); the latter to root the tree. Twenty-six viable sequences were obtained and showed a 100% similarity with P. pardalis, P. scrophus, P. joselimaianus, P. disjunctivus and Hypostomus plecostomus. The alignment resulted in no variability in the COX1 gene, likewise the distance matrix resulted in 0% divergence between the sampled sequences. The similarity tree yielded three different groups: one branch with the sequences of this study, one with the sequences added of the same genus; and a third group with the added Callichthyidae sequence.