Desarrollo de una Herramienta Bioinformática Interactiva en Lenguaje Python para Visualizar Asociaciones Biológicas

Abstract

El auge de las tecnologías ómicas se ha generado por el desarrollo de técnicas de alto rendimiento en el área de la biología, las cuales, son capaces de generar grandes volúmenes de datos que contienen información suficiente del sistema como para estudiarlo. No obstante, el análisis del procesamiento y la representación de resultados obtenidos de un gran volumen de datos es ineficiente cuando se utilizan los medios tradicionales. A raíz de esta problemática, entra en juego el rol de la bioinformática, la cual, es una herramienta sumamente debido a que permite identificar y medir un gran número de datos, así como almacenar y representar dicha información. Una herramienta de la biotecnología que ha destacado últimamente por su forma de representar dichos resultados es el diagrama de acordes, el cual, es un gráfico interactivo con un formato circular usualmente utilizado he implementado en muchas disciplinas para identificar y analizar patrones en diferentes tipos de redes. Los diagramas de acordes son construidos a partir de matrices/listas de adyacencia donde a cada valor se le llama nodo y estos a su vez, están organizados y distribuidos a lo largo de un círculo, donde los nodos van a estar conectados entre sí mediante el uso de arcos o curvas de Bézier con el fin de crear las conexiones, sin embargo, en la mayoría de éstos gráficos existen ciertas complicaciones que hacen que la experiencia para el usuario pueda ser tediosa o incluso molesta. Por consiguiente, en este trabajo se planteó el desarrollo de una interfaz gráfica bioinformática e interactiva en lenguaje Python para visualizar asociaciones/interacciones biológicas entre datos provenientes de tecnologías Ómicas, con el fin de que cualquier usuario con conocimientos nulos o avanzados de bioinformática pueda utilizarla para fines académicos o científicos.