Búsqueda y análisis de información de estructuras tipo porfirinas para el diseño de nuevos compuestos

Abstract

En este trabajo se analizaron las relaciones estructura-actividad para un grupo de derivados del compuesto 5,10,15,20-tetrafenilporfirina con actividad anticancerígena y antibacteriana frente a líneas celulares HCT-116, HeLa, MCF-7 y MDA-MB-231, así como contra las bacterias Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus. Se obtuvo la concentración inhibitoria 50 y la concentración mínima bactericida para el cálculo de descriptores, junto con el código SMILES de cada estructura encontrada en la literatura. Se empleó el programa informático BuildQSAR, para construir y analizar modelos QSAR que contengan de uno hasta seis descriptores significativos o no significativos dentro del modelo y se analizó la matriz de correlación de cada modelo para confirmar que los descriptores no son colineales. Los modelos QSAR obtenidos presentaron una r2 con valor más cercano a 1, Q2 > 0.5 y R2-Q2 sea < 0.3; fueron evaluados por una validacion interna cruzada con el método de Leave-One-Out y una validación externa usando un conjunto de entrenamiento y un conjunto de prueba, aproximadamente de 70% y 30%, respectivamente. Los modelos seleccionados indicaron una adecuada capacidad predictiva para proponer nuevas moléculas cuyas características están relacionadas con los descriptores obtenidos de cada línea celular cancerigena y las diversas bacterias. Se analizó cada molécula propuesta y se seleccionaron aquellas cuya actividad predicha fueron más activas en comparación a las encontradas en la literatura.