Evaluación del uso de información genómica para la selección de peso corporal a la cosecha en camarón blanco del pacífico (litopenaeus vannamei) en estanquería comercial

Abstract

El objetivo de este estudio fue estimar parámetros genéticos para el peso corporal a la cosecha (P180D) en camarón blanco del Pacífico (Litopenaeus vannamei) utilizando información genealógica y genómica, así como realizar un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) para identificar regiones genómicas asociadas con esta característica. Se utilizaron registros productivos y datos genómicos de 5,850 organismos provenientes de estanque comercial. La heredabilidad estimada a partir de información de pedigrí fue de 0.26 ± 0.06, con un efecto común de familia de 0.09 ± 0.02, mientras que la heredabilidad estimada con información genómica fue de 0.19 ± 0.02, con un efecto común de familia de 0.12 ± 0.02. Estos resultados indican la presencia de variación genética aditiva para el peso corporal a la cosecha en esta población. El análisis de asociación del genoma completo se realizó utilizando 21,407 SNPs posteriores al control de calidad, estimándose una heredabilidad basada en SNPs de 0.23 ± 0.02. Además se identificaron tres ventanas genómicas con una proporción de varianza explicada mayor al 1 %, localizadas en los grupos de ligamiento 15, 30 y 34, asociadas con la variación del peso corporal a la cosecha. En estas regiones se identifico un gen putativo asociado a la producción de actina.