Compendio de ejercicios virtuales de farmacología

Abstract

Drugs as a main tool in healthcare need to be analyzed to demonstrate their therapeutic effect. The target cells and organs where the drug performs its function need to be studied as precisely as possible to avoid adverse or unwanted effects on other cells or organs. The emergence of software that allows the practice and analysis of interactions between cells, organs and others with drugs, allows several advantages, from reducing or eradicating the use of laboratory animals, costs, food, care, time and other benefits. In the present work, a manual that addresses virtual exercises of pharmacology that facilitate the analysis and understanding of how drugs act on their therapeutic targets, carrying out a review and analysis of articles on platforms such as Web of Science, PubMed, SciFinder, Google Academic, etc., and also the investigation of the characteristics, installation and management of programs on molecular docking and virtual simulators to develop exercises with pharmacological simulators of free access to study and understand the effect that the drug has on the organism. The present work is divided into two chapters. In the first one, virtual exercises and a guide for the installation and use of the program OBSim: Organ Bath Simulation (Strathclyde Pharmacology Simulations) are developed, which simulates pharmacological experiments in isolated tissues or complete animals, applying a variety of drugs in variable concentrations to observe their pharmacological effects. In the second, virtual exercises and guides are developed for the installation and management of various programs, which are complemented to perform molecular docking, predicting the interaction between a drug and a protein at the molecular level.

Los fármacos como una herramienta principal en la salud necesitan ser analizados para comprobar su efecto terapéutico. Las células y los órganos diana donde el fármaco realiza su función, necesita estudiarse con la mayor precisión posible para así evitar efectos adversos o no deseados en otras células u órganos. El surgimiento de software que permita realizar prácticas y análisis de las interacciones entre células, órganos y demás con fármacos, permite varias ventajas, desde disminuir o erradicar el uso de animales de laboratorio, costos, alimentación, cuidados, tiempo y demás beneficios. En el presente trabajo, se realiza un manual que aborda ejercicios virtuales de farmacología que faciliten el análisis y la comprensión de cómo actúan los fármacos sobre sus dianas terapéuticas, llevando a cabo una revisión y análisis de artículos en plataformas como Web of Science, PubMed, SciFinder, Google Academic, etc., e igualmente la investigación de las características, instalación y manejo de programas sobre docking molecular y simuladores virtuales para elaborar ejercicios con simuladores farmacológicos de acceso libre para estudiar y comprender el efecto que tiene el fármaco sobre el organismo. El presente trabajo se divide en dos capítulos, en el primero, se elaboran ejercicios virtuales y una guía para la instalación y manejo del programa OBSim: Organ Bath Simulation (Strathclyde Pharmacology Simulations), el cual simula experimentos farmacológicos en tejidos aislados o animales completos, aplicando una variedad de medicamentos en concentraciones variables para lograr observar sus efectos farmacológicos. En el segundo, se elaboran ejercicios virtuales y guías para la instalación y manejo de diversos programas, los cuales se complementan para realizar acoplamiento molecular, prediciendo la interacción entre un fármaco y una proteína a nivel molecular.