Identificación molecular de bifidobacterias

Abstract

Las bifidobacterias son microorganismos Gram positivos anaerobios, son el grupo más importante de bacterias sacarolíticas del intestino grueso con presencia del 25% en adultos y 95% en recién nacidos alimentados con leche materna. Estas bacterias se relacionan con múltiples beneficios para el organismo humano como mejoramiento del proceso de digestión, prevención del desarrollo de determinados tumores, disminución de la incidencia de alergias, control de diarrea, entre muchos otros. Debido a la gran importancia que tienen las bifidobacterias en la salud, este trabajo tuvo como objetivo optimizar su identificación molecular para facilitar su estudio en diversas pruebas. La optimización se llevó a cabo por medio de tres pasos principales: extracción de ADN, amplificación por PCR, secuenciación y alineamiento de secuencias en BLAST. Se encontró que el método fenol-cloroformo permite obtener muestras de pureza óptima a aceptable en la mayoría de las muestras analizadas para poder llevar a cabo la posterior amplificación por medio de PCR siguiendo las condiciones de desnaturalización a 94°C / 5 minutos; 30 ciclos de: desnaturalización a 94°C / 1 minuto, alineamiento a 57°C / 1 minuto, extensión a 72°C / 1 minuto y una extensión final a 72°C / 5 minutos. Los fragmentos amplificados fueron purificados y secuenciados, lo que permitió conocer la especie por medio de un alineamiento en BLAST.